2014年5-10月，由黑龙江省文物考古研究所领衔，会同侵华日军第七三一部队罪证陈列馆、哈尔滨工业大学土木工程学院、东北师范大学历史文化学院，对细菌实验室及特设监狱遗址进行了全面揭露。细菌实验室及特设监狱地位显要，居于七三一部队本部核心区南部中央，实际呈长方形，东西长150.14米，南北宽100.02米，占地面积15，017平方米。由细菌实验室、特设监狱、中心走廊及庭院四部分构成。细菌实验室原为四周合围封闭的长方形平顶三层楼房，中心走廊南北纵贯细菌实验室及特设监狱，将其隔离成东院与西院。特设监狱为二座长方形坡顶二层楼房，分别横向置于东院和西院的正中。本次发掘一方面对“四方楼”地下基础部分进行了完整揭露，搞清了其整体格局；另方面采用先进仪器对其行了实测，全方位地获取了精确数据。