如果只有两个已知水准点，进行四等符合水准测量时线路超长，可以采取以下措施：

1. 使用GPS进行更准确的坐标控制点设置，通过GPS控制测量来获取更准确的坐标数据。
2. 增加水准测量的次数，尽量保证每次水准测量时前后视距相等或相近，以减少误差的传播和累积。
3. 使用高精度水准仪和尺进行测量，提高测量精度。
4. 考虑使用其他辅助方法，如三角高程测量、距离交会法等，来辅助水准测量。
5. 在线路中分段进行水准测量，并对各段数据进行分析，以减小误差的影响。
6. 在无法使用更多已知点的情况下，利用已有的数据点建立数学模型，进行预测和控制误差。

请注意，所有这些方法都需要经过专业训练的水准测量人员的操作，以确保测量结果的准确性和可靠性。在进行任何测量时，都应遵守相关规定和操作规程。