全书共计12个部分，包括导论、第一章自然突变率、第二章Hardy-Weinberg平衡定律应用、第三章基因频率的定向变化、第四章基因频率的随机变化、第五章基因频率分布与进化过程、第六章群体中的遗传变异、第七章群体结构与系统分化、第八章系统分类、第九章DNA与氨基酸序列的遗传演变、第十章分子进化与“分子进化钟”、第十一章动物遗传资源保种。本教材系统地总结了国际、国内这一研究领域的主要理论和研究成果，并与之配套提供了大量的数据分析和应用实例，深刻地阐明了动物群体遗传学所涉及的遗传学、数理统计学、进化论原理等内容，全面地提供了动物遗传资源评价所涉及的群体遗传学理论及分析方法，为其他相关实践领域提供了借鉴思路和具体方法，也为从事动物遗传相关研究的人士拓展了视野，有力地推动了我国动物遗传资源事业和当代动物遗传资源科学的进一步发展。