我国重点大学建设是国家重点建设项目，是以国家行政权力支配高等教育资源的制度安排，在政策目标、政策内容、实施程序、政策评估等方面具有鲜明的制度化的精英主义。以H省为个案，揭示重点学科建设对一般高校发展带来的影响和挑战。重点大学建设对高等教育系统的影响表现为公平问题与质量问题两个方面。重点大学建设对非重点高校发展的影响具体体现为办学理念、发展规划、战略重点、学校管理制度、经费投入及分配等，这种影响是通过重点大学建设的部门规制（准入制度、经费控制、管理制度和评价制度）和潜在规范（“钦定”身份、“血统”观念、“运作”机制等）两个方面来达成的。重点大学建设制度存在科学、公平、公开等问题，对一般高校健康发展产生了一些消极影响，需要借鉴日本21世纪COE计划的做法和经验，树立制度公平理念，制定补救政策，积极推动一般高校多元化发展战略转型，促进其健康、有序、多样化发展。