2016年是中国科协全面启动科协系统深化改革的起始之年，也是全面落实《中国科学技术协会事业发展“十三五”规划（2016—2020）》，各项工作发展取得重要成绩的一年。为更好贯彻落实中共中央、国务院重大战略决策部署，贯彻落实习近平总书记对中国科协职责定位和发展方向重要指示，中国科协创新战略研究院于2016年12月2—4日在杭州举办主题为“深化改革与创新发展”的第二届科协发展理论研讨会，搭建平台，凝聚智慧，为科协事业繁荣发展献计献策。本论文集共收录了第二届科协发展理论研讨会近40篇论文，这些论文对创新驱动发展、科技评估、科学文化、科协系统深化改革与发展、智库建设等提出了建设性意见，具有较高的决策参考价值。