全书共5章，第1章是太湖及太湖流域简介，分析了太湖的地理、气候、植被、土壤和水系等特征；第2章主要介绍了太湖流域分区及其污染特征；第3章主要介绍了太湖流域土地利用、社会经济、产业结构调查及结果；第4章为太湖流域污染源状况，分别介绍了污染源调查技术路线、工业源排放量与入河量、城镇生活源排放量与入河量、农村生活源排放量与入河量、种植业源排放量与入河量、养殖业源排放量与入河量及其他源排放量与入河量等；第5章为太湖流域生态圈层状况及演变趋势分析，主要介绍了太湖流域生态圈层概述、河网水生态特征分析、湖荡水生态特征分析、水源涵养林生态特征分析、湖滨缓冲带水生态状况及演变趋势分析，以及太湖水体水生态状况及演变趋势分析等。