本书结合网络拓扑结构和多元生物数据，深入研究了蛋白质复合物检测、关键蛋白质识别和蛋白质功能预测等几个研究热点问题。全书分为六章。第一章介绍了相关研究背景；第二章结合不确定数据管理技术和复合物核-附件结构，提出了一种基于不确定网络的复合物识别方法DCU；第三章提出了一种基于重叠关键模块的关键蛋白质识别方法POEM；第四章结合PPI网络和蛋白质结构域信息构建了一个加权多重边网络，并为每种类型的相互作用赋予不同的遍历优先级；第五章结合PPI网络和基因表达数据，构建了一个动态蛋白质相互作用网络，提高蛋白质功能预测的准确率；第六章为总结和展望。