上海2016年更换CA证书所需资料如下：

* 企业法人营业执照副本原件及复印件。
* 组织机构代码证原件及复印件。
* 税务登记证原件及复印件。
* 法定代表人身份证原件及复印件。
* 经办人身份证原件及复印件，及公司授权委托书。
* 原CA证书。

三证合一后，更换CA证书所需资料如下：

* 新营业执照副本复印件。
* 组织机构代码证复印件。
* 税务登记证（国税和地税）上交的正副本原件及加盖公章和法定代表人签字（或盖章）的委托书（如果有）。
* 原CA证书原件及复印件。
* 法人身份证原件及复印件。

请注意查看上海相关部门发布的官方文件和通知，以获取最准确的信息。更换CA证书可能需要一些时间，请提前安排。