扁平疣通常是一种自限性疾病，大多数患者可以自然消退，但可能需要数年时间。虽然扁平疣可以自行消失，但过程可能会很漫长且痛苦。

对于一些希望去除扁平疣的患者，可以通过一些方法进行治疗。治疗方法包括药物治疗、物理治疗和手术切除。其中，一些外用药物如维A酸软膏、咪喹莫特等，可以通过免疫调节和抗病毒作用来减轻症状。物理治疗如冷冻疗法、激光疗法等，可以通过破坏疣体来达到治疗效果。手术切除则更适合于较大的、影响外观的疣体。

然而，扁平疣的治疗效果因个体差异而异，而且不能保证根除。有些患者在治疗后仍然可能复发。此外，扁平疣的治疗也可能带来一些副作用，如疼痛、疤痕形成等。因此，在选择治疗方法时，患者应权衡利弊，并咨询专业医生的建议。

总之，扁平疣是否可以根除存在个体差异，治疗方法的疗效和复发率也因个体情况而异。如果患有扁平疣，建议及时就医，根据医生建议选择合适的治疗方法，以期达到最佳治疗效果。同时，保持良好的生活习惯和加强免疫力，有助于减少扁平疣的发生和加重。