引起生物变异的原因主要有以下几种：

1. 基因突变：基因在分子水平上表现出来的变化。
2. 基因重组：生物在生殖过程中，控制不同性状的基因重新组合。
3. 染色体变异：染色体结构和数目的改变。
4. 环境因素：包括物理的（如各种射线、温度、湿度等）、化学的（如各种酸、碱、重金属、农药、致癌物质等）和生物的（如寄生虫感染、传染病等）多种因素。
5. 基因水平变化：包括基因水平转移和基因克隆。基因水平转移主要指通过流水或接触等生物间的相互接触实现基因的水平转移。

这些因素中，除了基因突变、基因重组和染色体变异具有普遍意义外，其他变异在自然界中是极少发生的。变异的原因有很多，对于不同生物而言，可能有所不同。这些变异的发生可能会影响生物的生存和繁衍，科学家们一直在努力研究和探索变异的原因和影响。