在项目审计过程中，如果审计单位要求扣除横向、纵向填挖交界处的挖方工程量，承包单位可以按照以下方式进行解释和应对：

1. 按照合同条款：首先，承包单位可以仔细查阅与审计单位签订的合同条款，以确定是否有关于工程量扣除的明确规定。如果有相关条款，可以根据条款内容进行解释和争辩。
2. 工程量计算方法：承包单位可以向审计单位解释挖方工程的计算方法。在横向、纵向填挖交界处，挖方工程量通常需要根据现场实际情况进行分别计量。如果审计单位认为存在不合理的重叠部分，可以提供相关记录和证据，以证明计算准确。
3. 工程设计文件：承包单位可以提供工程设计文件和图纸，以证明在施工前已经对现场进行了详细勘察，并按照设计要求进行施工。这些文件可以作为支持挖方工程量合理的证据。
4. 监理单位意见：如果承包单位与监理单位有合作，可以请求监理单位出具相关证明文件，证明承包单位在施工过程中按照规定进行挖方工程量的计算和施工。
5. 沟通协商：在出现争议时，承包单位可以与审计单位进行沟通协商，寻求合理的解决方案。双方可以共同派人前往现场进行勘察，了解实际情况，以便达成共识。
6. 法律途径：如果沟通协商无果，承包单位可以考虑采取法律途径维护自己的权益。可以寻求专业律师的帮助，对相关争议进行法律分析和诉讼准备。

总之，承包单位应该认真对待审计单位的意见，并积极寻求合理的解释和解决方案。在与审计单位沟通协商的过程中，保持诚实、守信和尊重的态度也很重要。