二类医疗器械经营备案办理流程如下：

1. 准备营业执照：申请二类医疗器械经营备案需要先办理营业执照，因为三类医疗器械经营许可证需要用到营业执照。
2. 申请并取得相关许可：根据公司经营范围和当地要求，申请办理二类医疗器械经营许可证。
3. 提交备案申请：完成相关准备后，向所在地设区的市级负责药品监督管理的部门提交备案申请和相关资料。
4. 现场核查：在提交申请后，负责药品监督管理的部门可能会进行现场核查，这时需要积极配合。
5. 备案成功：如果医疗器械经营企业需要销售二类医疗器械，且当地已经实施备案制度，那么该企业需要在所在地设区的市级负责药品监督管理的部门进行备案。完成备案后，就可以合法地销售二类医疗器械产品了。

注意不同地区的具体要求可能会有所不同，应参考当地的政策和具体要求。此外，企业应该保证经营产品的质量和安全，并积极配合监管部门的检查。

希望以上信息对你有帮助。