这句话的意思是乙方应该按照每日千分之三的比例向甲方支付违约金。一般来说，违约金的计算方式可以根据合同中的规定或者法律规定来进行，通常是根据违约的严重程度、数额、对对方造成的影响等多个因素来确定的。在上述的语境中，每日千分之三的违约金比例算是比较高的一种，通常在合同中约定这种比例时，可能是考虑到乙方违约的严重程度或者违约的频率比较高。然而，具体的计算方式和标准需要参考合同的具体内容来确定。