过于分散、配置成效不明显等诸多问题，最终导致汽车产业R&D配置失效。针对汽车产业R&D融资与配置存在的问题及其原因，一是要根据政府理性行为体假说、公共产品供给理论和政府干预理论，运用政府税收行为——开征研发税解决R&D融资市场失灵，并将征税所得专项支出用于汽车产业自主创新；同时通过创新政府官员绩效评价体系和发挥财政R&D“药引子”作用鼓励民间资本、金融资本投入自主创新活动，以确保汽车产业R&D有效融资。二是基于重点跨越、支撑发展、引领未来的汽车产业自主创新战略目标，要创新R&D配置模式，从科研立项—科技成果评定验收—科技成果转化的整个过程都要充分引入市场机制，遵循公平透明、竞争择优的原则进行；要构建产学研联盟长效利益均衡机制与研发人才产学研联合培养机制；要优化R&D配置结构，尤其是提高对基础研究和高校的R&D配置比重；要基于开征研发税构建核心关键技术R&D经费优先与保障机制，使R&D配置保证重点、全面均衡，确保汽车产业R&D有效配置。