关于皇侃思想的研究，以往的学术界主要从经学研究的角度，揭示其三教杂融特点，较缺乏哲学研究的理论深度。从思想来源看，皇侃继承了传统性论中“即生言性”与“用气为性”的思想，尤其是受到告子、荀子及汉魏诸儒“顺气言性”思想的影响，注重阐发人性中天然具有的合理性，及其在现实中基于这种合理性而去恢复人的自然真情。同样，立足于自然人性论，皇侃认为孝与仁在本质上是一致的，由行孝推广至行仁，不仅包括事亲之的行为，也涉及到风政教化，从而皇侃将家庭伦理层面的个体行孝与国家伦理层面的忠君思想相结合。皇侃应时而起，立足于儒学传统，通过解经阐发了其具有明显汉魏特色的气性论哲学，展现了此一时期的儒学发展的特点，成为了魏晋南北朝儒学发展史上的一枝奇葩。