伊宁市的主要污染源包括：

1. 大气污染源：包括工业企业生产过程中排放的烟尘、废气和汽车排放的尾气等。
2. 水体污染源：包括生活污水、造纸、印染、皮革和食品加工等工业企业的废水。
3. 固体废弃物污染源：包括各种垃圾、废渣和污泥等。
4. 噪声污染源：包括交通噪声、工业噪声、社会生活噪声等。

以上列举的污染源对环境和生态系统造成了影响，需要采取相应的措施进行治理和保护。