医药行业P3实验室的审批部门主要包括以下三个：

* **国家卫生健康委员会**。作为医药行业的主管部门，负责制定P3实验室的规划、建设和管理标准，并对相关实验室的审批拥有最终决定权。
* **药品监督管理局**。负责药品、生物制品等产品的监管，P3实验室的相关技术标准和规范由其制定，实验室的设立需其审批通过。
* **生态环境部**。主要负责环境监测和环境保护方面的审批，在P3实验室的审批过程中，会对其环保设施进行审核。

总的来说，这三个部门在P3实验室的审批过程中起着重要的作用。同时，具体流程可能会根据不同地区的规定略有差异。请在申请前仔细阅读相关规定，并按照要求提交申请。