香港大药房的盐酸阿莫罗芬和楚甲在作用机制和用途上存在一些区别。

盐酸阿莫罗芬是一种广谱抗真菌药物，主要作用是抑制真菌细胞膜麦角固醇的生物合成，影响麦角固醇的通透性，从而发挥抗真菌作用。它主要用于治疗皮肤真菌感染，如灰指甲（甲癣）等。

楚甲则是一种有机磷化合物，主要作用是抑制真菌有氧呼吸，从而起到抗真菌作用。它主要用于皮肤藓菌感染，如体股癣、手足癣等。

因此，盐酸阿莫罗芬主要用于治疗灰指甲（甲癣），而楚甲则适用于皮肤藓菌感染的治疗。在适用范围和用途上存在一定的区别。在使用这两种药物时，建议遵循专业医生的建议和医嘱，切勿随意自行用药。