中国居民营养与慢性病状况报告的数据收集方式主要包括以下几种：

1. 调查问卷：通过问卷调查收集居民的饮食、运动、吸烟、饮酒等生活习惯，以及身高、体重、血压等健康状况。
2. 实验室检查：通过对居民的血液、尿液、体液等进行实验室检查，了解其营养状况、代谢情况等。
3. 访谈：通过访谈了解居民的饮食结构、烹饪方式、运动习惯等。
4. 监测系统：通过建立监测系统，对慢性病发病、死亡和健康相关因素进行监测，及时了解变化趋势。
5. 医疗机构数据：医疗机构是慢性病管理的重要场所，其数据对于了解居民慢性病发病和死亡情况具有重要意义。

总的来说，这些数据是通过多种方式收集而来的，以确保报告的准确性和可靠性。