咨询工程师继续教育普通课程和微课之间的区别主要表现在课程形式和学时方面。

1. 课程形式：普通课程通常是传统的线下授课形式，而微课则是通过视频授课，可以自由安排时间学习。
2. 学时：普通课程一个学时通常是60分钟，而微课每个课程的时长通常在5-10分钟。

总的来说，这两种学习方式各有特点。普通课程可能更适合没有时间限制，或者需要更多时间来处理日常工作的人；而微课则更适合那些时间比较紧张，需要快速获取咨询工程师继续教育知识的人。具体选择哪种方式，可以根据自己的实际情况来决定。