在隐蔽致灾因素普查施工过程中的安全措施包括以下几点：

1. 设立专门的安全管理机构，建立健全安全管理规章制度，明确安全管理责任人。
2. 对施工区域进行封闭式管理，设置明显的安全警示标志，做好安全防护工作。
3. 制定完善的安全应急预案，并定期进行演练。
4. 对施工人员进行安全教育和培训，提高他们的安全意识和技能水平。
5. 严格执行安全检查制度，及时发现和整改安全隐患。
6. 做好施工现场的消防安全工作，确保消防设施完备，无火灾隐患。
7. 严格执行相关环保规定，保护环境，避免污染和破坏现场。
8. 在施工过程中，要密切关注天气变化，及时采取应对措施，确保施工安全。

总之，要确保隐蔽致灾因素普查施工过程中的安全措施得到全面落实，确保施工人员的生命安全和健康，同时也要确保施工质量和进度不受影响。