全国总工会与人力资源社会保障部在推动一函两书协作的重点包括以下几个方面：

1. 推动企业建立健全劳动规章制度，明确企业与劳动者双方权利义务，减少劳动争议。
2. 推动企业完善工资支付保障机制，确保劳动者按时足额获得工资。
3. 加强对企业落实劳动保障法律法规情况的监督检查，依法惩处违法行为。
4. 积极配合有关部门开展根治欠薪工作，维护劳动者合法权益。
5. 及时向劳动者发送督促函，敦促用人单位履行法定义务，切实维护劳动者权益。
6. 做好维权服务工作，向劳动者提供法律援助和支持，帮助劳动者解决实际问题。

通过以上协作重点，全国总工会与人力资源社会保障部共同致力于推动用人单位规范用工管理，加强劳动保障法律法规的宣传和执行，切实维护劳动者的合法权益。