对于审计局审计发现关联公司的问题，可以按照以下方式进行回复：

尊敬的审计局领导：

在此，我们对您关注的问题表示衷心的感谢，并将对此事进行深入调查。

根据您的反馈，我们了解到在我们的服务范围内存在关联公司的情况。我们十分重视这一情况，并会立即展开全面调查，以确认是否存在违反规定的行为。

如果发现有任何违反规定的行为，我们将严肃处理，并确保此类行为不会再次发生。我们的目标是维护公共资金的正当使用，并确保所有与我们有业务关系的企业符合所有相关法规和政策。

我们非常重视与审计局的合作关系，并期待继续与您保持沟通，以共同维护公共资金的正当使用。

再次感谢您的关注和努力。

此致
敬礼！

[你的名字]
[你的职位]
[公司名称]
[日期]

以上内容仅供参考，请您根据自身实际情况撰写。