是的，小规模纳税企业的年度收入超过500万元通常是以会计年度为计算周期。会计年度是指从每年的1月1日至12月31日，是一个完整的时间周期，用于会计报表的编制和财务分析。

对于小规模纳税企业来说，如果年度收入超过500万元，可能会面临一些税收风险和税务检查。这是因为根据国家税务总局的规定，小规模纳税人企业需要按照规定申报纳税，并保持财务记录的完整和准确。如果企业的年度收入超过500万元，税务机关可能会更加关注企业的财务状况和纳税情况，并进行税务检查以确认企业是否遵守了相关税收法规。

因此，小规模纳税企业应该按照国家税务总局的规定，及时申报纳税，保持财务记录的完整和准确，以避免不必要的税收风险和损失。