萧县陈沟棚改停工的原因可能有以下几点：

1. 资金链断裂：陈沟棚改项目可能出现了资金问题，导致项目停工。
2. 政策调整：政策的变化也可能导致项目停工。
3. 拆迁问题：拆迁进度缓慢或遇到困难，可能导致项目停工。
4. 规划调整：可能存在规划调整，导致项目停工。

总之，萧县陈沟棚改停工的原因是多方面的，具体原因需要进一步了解才能确定。