城市普通中小学校校舍建筑面积指标表有两个的原因可能如下：

1. 一个是适用于城市市区学校，另一个是适用于城市郊区，包括近郊农村的学校。这两个指标表分别对应了不同地区的学校，可能适用的建筑环境有所不同。
2. 不同表可能涵盖了不同的教学阶段，例如每个指标表可能对应于不同的校区大小或年级规模。

具体的情况可能根据地区和政策有所不同，可以参考官方文件或者咨询相关教育部门了解更多信息。