手动挡汽车5挡齿轮更换后五档行驶档杆后移可能是由于以下原因：

1. 齿轮磨损：如果5挡齿轮发生磨损，可能会变得不规则，可能影响齿轮啮合间隙，使齿轮移动。
2. 齿间隙调整不当：齿隙调整不当可能会影响变速器结构，从而出现档杆后移的现象。
3. 零件老化：可能是因为一些零件出现老化或松动，导致档杆后移。
4. 操作问题：在更换齿轮或其他维修操作过程中，如果操作不正确，也可能导致档杆后移。

这种情况如果出现了档杆与车厢体结合部位松动的现象，无法自行处理。建议您及时联系专业维修人员进行检查和调整，以确保车辆的正常使用。