项目中标后被质疑三次，可以参考以下做法：

1. 确认质疑内容：仔细阅读质疑内容，关注其是否有合理成分，是否符合事实，以免做出过度反应。
2. 核实质疑内容：做好核实工作，了解实际情况，以便向质疑方做出合理解释和说明。
3. 协商解决：与质疑方保持沟通，了解对方诉求，说明招标过程当中的不合理之处，说明中标价格合理性，尽量协商解决。
4. 必要时公示：如果质疑内容涉及到招标文件或投标商的商业行为，如存在明显不公或违规现象，可以在官方平台上进行公示，以示公正。
5. 法律途径：如果在质疑协商和公示过程中无法得到满意解决，可以考虑走法律途径，联系相关部门或机构进行处理和仲裁。

在整个过程中，需要保持冷静、客观，并遵循相关法律法规，确保整个过程公正、透明。