如果内河水域未被认定为通航而通行游船，可以采取以下措施：

1. 了解当地法规：确保了解当地法规和规定，特别是与内河水域管理和通航有关的规定。这将有助于确定该水域是否被视为通航，以及游船是否在该水域上合法运营。
2. 申请许可证：如果游船运营需要许可证或其他许可，请确保按照相关要求申请许可证。这将有助于确保游船合法运营，并避免任何法律纠纷。
3. 与当地当局沟通：与当地水上管理部门或相关机构进行沟通，了解该水域的管理规定和要求。他们可能会提供指导或解决方案，以确保游船在该水域上合法运营。
4. 遵守规定：无论如何，确保游船的运营符合当地法规和规定，并遵守所有适用的要求和限制。这可能包括船舶大小、速度、安全设施等方面的规定。
5. 寻求法律咨询：如果仍然面临问题或纠纷，考虑寻求法律咨询。律师可以提供有关当地法律和规定的详细信息，并帮助解决问题。

总之，了解当地法规和规定是关键，并与当地水上管理部门或相关机构保持沟通，以确保游船在该水域上合法运营。