对于民事案件强制执行过程中，法院已查封的财产被另一法院执行并拍卖的情况，可以参考以下处理方式：

1. 了解法律程序和规定：在处理这个问题时，首先要了解相关法律程序和规定，包括执行程序中的财产移交、轮候查封、拍卖等环节。
2. 沟通协调：与两个有管辖权的法院进行沟通协调，了解财产的具体情况，包括财产的现状、拍卖的进展等，并表达自己的诉求。
3. 寻求司法救济：如果财产已经被拍卖，可以寻求相关的司法救济途径，包括提起执行异议、申请复议等，争取维护自己的合法权益。
4. 咨询专业律师：如果感到困惑和不安，可以咨询专业的律师，获取更有针对性的法律意见和建议。

总之，遇到这种情况，当事人应该保持冷静，了解相关法律规定，积极沟通协调，并寻求合适的司法救济途径。