国有企业单位收到公安机关醉驾告知函时，通常会按照相关程序进行处理。通常，这种告知函会要求相关人员前往公安机关进行进一步的处理。在处理过程中，需要核实具体情况和事实，如是否存在醉驾行为等。

是否列为问题线索通常取决于具体情况和国有企业单位的相关规定。国有企业单位可能会根据告知函的内容和实际情况，对相关人员进行调查和处理，并根据调查结果决定是否将其列为问题线索。

在处理过程中，国有企业单位应该遵守相关法律法规和规定，确保处理过程的公正、透明和合法。同时，也应该加强内部管理，加强员工的法治教育和培训，提高员工法律意识和遵纪守法意识，防止类似事件再次发生。

总的来说，这需要根据实际情况进行判断，而且公安机关、国有企业的内部处理方式也不尽相同。在面对这类问题时，一定要严格遵守法律法规，避免出现违法行为。