二级造价工程师准予变更通知书应由以下几部分组成：

1. **封面**：写明“二级造价工程师准予变更通知书”及公章等。
2. **正文**：说明变更事项及原因，写明变更前的情况、现变更后的内容以及注意事项。按照国家相关规定，给予原注册（或登记）证书作废并新证收回，如无异常情况，新证给予发放。对于变更姓名或注册/登记范围，要写明其资格证书号，并在考区提出申请变更。同时要附带新的身份证件和已注销的资格证书的复印件。
3. **落款**：签上办理单位的公章和日期。
4. **附件**：需附带申请者的二级造价工程师执业资格证书、身份证明复印件以及相关证明材料。

注意，填写变更申请时应按照实际情况填写，确保信息的准确性。以上仅供参考，具体情况请以官方要求为准。