如果法院强制拍卖房产的款项不足以清偿房屋抵押权人，有以下几种处理方式：

1. 剩余债务可以向法院申请执行，法院可以中止执行，待债权人再行执行。
2. 债务人可以再次向债权人借款，用该借款偿还剩余债务，然后再申请法院恢复执行。
3. 债务人可以与债权人协商分期偿还一部分债务。

以上建议仅供参考，如果您对此类问题仍有疑问，建议咨询法律专业人士以获取专业建议。