针对棚户区改造协议已经签订6年多却未履行的情况，可以采取以下方法维权：

1. 再次联系城投公司询问棚户区改造的进展情况，以及补偿款的用途。如果还未动工，需要再次收集证据证明时间跨度，同时可以收集其他业主的诉求证明。
2. 如果未果，可以找律师咨询，必要时，通过法律途径维护权益。其中要谨慎选择律师事务所，并保留好相关证据，如合同、协议、补偿款支付凭证等。
3. 向房屋管理部门或者城市规划部门查询改造的审批材料，以及城投公司的相关资质，了解项目停滞的原因。
4. 如果居民的房屋补偿款已经达到了法定追诉期限，那么需要与律师协商是否可以通过刑事案件来维权。
5. 如果以上步骤完成后仍无法解决问题，可以尝试通过媒体发声，增加政府和相关方的压力，加快问题解决。

总之，要保持冷静，尽可能地收集证据，寻求律师和法律帮助，同时注意不要激化矛盾，以和平方式解决问题。如果棚户区改造涉及众多居民且长期未得到解决，可能涉及政府失职或违法，可以考虑集体维权并寻求媒体、司法和法律途径解决。