在立案阶段申请立案庭法官回避的步骤如下：

1. 写好申请书。申请书中陈述的应具体明确，如申请回避的理由为与当事人有某种利害关系而可能影响公正审理等。
2. 将申请书提交给立案庭法官或法院相关负责人。
3. 根据法院的相关规定进行审核和安排。法院在接到当事人提出的申请后，会进行审核，如果认为有必要，可能会进行相关调查。如果案情不影响公正审理，法院可能不会同意回避申请。

具体到每个法院的具体规定可能有所不同，建议向相关法院咨询以了解详细流程和规定。