对于途经地点相同的客运车辆，发班时间不同的情况，客运站可以采取以下措施处理售票事宜：

1. 区分不同发班时间的车票：在售票时，客运站可以根据车辆的预计发车时间来区分不同时间的车票，乘客可以根据自己的出行时间来购买相应时间班次的车票。
2. 提供灵活的购票方式：客运站可以通过提供多种购票方式，如线上购票、电话购票、现场购票等，方便乘客根据自己的时间和行程选择合适的班次。
3. 提供预售提醒服务：客运站可以与第三方平台合作，提供预售提醒服务，根据车辆的发车时间提前向乘客发送购票提醒，以便乘客提前购买相应时间班次的车票。
4. 调整售票时间和班次：如果发班时间不同的车次客流量较大，客运站可以根据实际情况调整售票时间和班次，以满足不同乘客的出行需求。
5. 提供咨询和预订服务：客运站可以设置专门的咨询和预订服务窗口，为乘客提供关于不同班次和时间的信息，并协助乘客预订车票。

总之，客运站在处理途经地点相同的客运车辆不同发班时间的售票问题时，应该根据实际情况灵活调整售票方式和班次，以满足不同乘客的出行需求。