HONOR 50 SE手机发热严重可能有以下原因：

1. 长时间使用手机应用程序，例如玩游戏、看视频等。
2. 周围环境温度较高，例如在夏天或太阳直射等环境中使用手机。
3. 手机上安装了一些性能较高且不兼容的第三方应用程序。
4. 手机系统出现异常或漏洞，需要修复。
5. 散热不佳，例如手机内部灰尘过多或使用了不适当的手机保护壳。

为了避免这些问题，您可以：

1. 避免长时间连续使用同一应用程序，适度休息一段时间再使用。
2. 将手机放在适宜的温度下使用，避免高温环境。
3. 卸载不兼容或性能过高的应用程序。
4. 检查并修复系统问题和漏洞。
5. 保持手机清洁，必要时可以使用软布或棉签清理手机内部。

如果以上方法都无法解决问题，建议您尝试重启手机并联系售后服务人员进行检修和进一步检查。