市政设施改造工程台风主要存在的风险包括但不限于以下几种：

1. 直接破坏风险：台风可能对施工现场的临时设施、脚手架、围墙、电缆等市政设施造成损害。
2. 人员伤害风险：强风可能使临时搭建的帐篷、简易房等建筑物倒塌，从而造成现场施工人员的伤害。
3. 洪水风险：台风带来的强降雨可能导致施工现场及周边地区出现洪水等自然灾害，对工程安全和人员生命造成威胁。
4. 交通风险：台风影响下，交通可能会受阻，影响施工人员和物资的进出场，进而可能延误工期并增加成本。
5. 疫情风险：施工现场与市政设施改造工程相关，可能涉及大量人员和物资的流动，因此也可能面临疫情传播的风险。
6. 施工暂停风险：如果台风预警发布后施工人员未能及时撤离，可能会导致施工现场部分或全部停工，进而影响工程进度。
7. 物料损失风险：市政设施改造工程中使用的部分物料可能较轻，容易受到台风的影响而遭受损失。

为了降低这些风险，施工单位应提前做好防范工作，例如加固临时设施、清理施工现场的障碍物、制定应急预案并提前进行演练等。同时，应密切关注天气预报和预警信息，及时采取应对措施，确保人员安全和工程进度不受台风影响。