南方x3手簿工程之星3.0升级到工程之星50的步骤如下：

1. 将工程之星3.0连接电脑，下载升级驱动和升级程序。
2. 准备一个剩余空间足够的SD卡，并将其插入手簿SD卡槽中。
3. 将驱动和升级程序复制到SD卡中，重启手簿并进入recovery模式。
4. 双wipe操作，确认清楚数据后进行下一步操作。
5. 下载工程之星5.0的刷机包，并复制到SD卡中。
6. 重新启动手簿并进入recovery模式，选择从SD卡刷入升级包。
7. 等待升级包刷入完成，重启手簿，即可完成工程之星3.0到工程之星5.0的升级。

请注意，在操作过程中务必注意备份数据，并根据实际情况进行操作，以免造成数据损失或设备损坏。