如果银行上公司调查欠贷员工工资流水，公司可以按照以下步骤处理：

1. 了解情况：公司应了解员工贷款逾期的原因，并确定是否需要配合银行调查。
2. 通知员工：公司应通知员工与银行和公司进行联系，告知员工贷款逾期对公司的影响，并提醒员工采取积极的措施解决问题。
3. 提供证据：在银行调查时，公司应积极提供相关证据，如工资流水、劳动合同、社保缴纳记录等，以证明员工的工资收入和还款能力。
4. 解释政策：公司应该解释公司的贷款政策，并说明在员工贷款逾期后公司的处理方式。
5. 协助员工解决问题：如果员工确实面临还款困难，公司可以与银行协商，看是否可以提供一些帮助，如延长还款期限、减免部分利息等。

总之，公司应该积极配合银行调查，并尽可能地帮助员工解决问题，以维护公司的声誉和员工的利益。