如果高层次人才网上申报主管部门退回后，学校想要退回个人申报，可以按照以下步骤进行：

1. 仔细阅读退回理由，了解退回原因，并准备相应的解释材料。
2. 联系个人沟通，说明退回申报的原因，并提醒个人需要提供的补充材料。
3. 如果个人需要重新提交申请，学校应该提供重新申报的指南或模板，以便个人按照学校的要求重新提交。
4. 个人重新提交申请后，学校会进行审核，审核通过后才会退回个人申报。

学校可能会通过邮件通知个人审核结果，因此个人需要留意学校的相关邮件。如果在处理过程中遇到困难，可以向学校相关部门咨询，寻求帮助。