是的，废弃的烟囱水塔等构筑物需要进行防雷检测。虽然这些构筑物已经废弃，但是它们仍然可能存在雷击的风险。在雷雨天气中，这些构筑物可能成为雷电的通道，对周围的人员和设备造成危害。因此，需要进行防雷检测，确保它们符合防雷要求，并采取相应的防雷措施，如安装避雷针、接地线等，以保障人员和设备的安全。