屋顶保护层酥皮的原因主要有：

1. 防水材料质量不好，导致防水效果不佳，雨水渗漏进屋内。
2. 屋顶保护层与防水材料粘结不牢，导致保护层与防水材料分离，出现起皮现象。
3. 施工时涂层过厚或涂刷次数不够，导致保护层与防水材料无法有效粘结。
4. 施工环境温度不适宜，如温度过低可能导致粘结力度下降，出现起皮酥皮现象。
5. 屋顶长期受到阳光直射，热胀冷缩过快，也可能对保护层的质量产生影响。

为了避免屋顶保护层出现酥皮现象，应选择质量好的防水材料并确保施工质量和环境温度。如果出现酥皮现象，应及时进行修复，避免问题扩大。