是的，小微企业申报吸纳高校毕业生款项时，相关款项应打给公司。

大学生就业是一个全社会需要共同关注的问题。为了支持大学生创业、就业，政府也推出了一系列的优惠扶持政策，同时也提供了一定的补贴和奖励。对于小微企业而言，申报吸纳高校毕业生款项是一种补贴和奖励的申请方式。具体到申报过程中，款项一般会直接打给小微企业，而非发放给个人。当然，企业也应当根据当地政府或相关部门的政策要求，积极准备申报材料，确保申报流程的合规性和有效性。

以上信息仅供参考，如果您还有疑问，建议咨询当地政府或相关部门工作人员。