药剂科对临床科室基本药物使用情况的检查和处理通常包括以下几个方面：

1. 定期检查：药剂科会定期对临床科室使用的基本药物情况进行检查，包括药品库存、使用量、使用范围、使用效果等方面。
2. 审核处方：药剂科会审核临床科室医生开具的处方，确保处方中使用的药品符合基本药物目录和相关规定，同时关注药品的剂量、用法、有效期等方面。
3. 反馈与建议：药剂科会向临床科室反馈检查结果，并提供相关建议，如优化药品库存、调整药品使用范围和剂量、加强药品管理等方面。
4. 培训与指导：药剂科会定期为临床科室医护人员提供培训和指导，帮助他们了解基本药物相关知识、使用方法和注意事项等。
5. 监督与考核：药剂科会与医院相关部门共同对临床科室基本药物使用情况进行监督和考核，以确保用药安全、有效、经济合理。

处理方式可能会因医院和地区而异，但通常包括警告、罚款、暂停处方权、取消医生资格等。同时，药剂科也会积极参与临床科室的药物管理、药学服务、药物信息咨询等方面的工作，为临床科室提供专业的药学支持。