员工不配合公司内部调动被辞退，具体赔付情况需根据员工是否违反公司规定及劳动合同约定来确定。

首先，公司内部调动的决策通常需要与员工进行协商，并按照相关法律法规进行。如果员工违反了劳动合同的约定或者公司规章制度，导致不能胜任原工作，公司有权单方面解除劳动合同，并且不需要支付经济补偿金。

然而，如果公司内部调动决策是合理的，员工不配合调动的行为可能构成违反劳动合同的行为。在这种情况下，公司可以按照相关法律法规的规定，依法解除劳动合同，并依法支付经济补偿金。

一般来说，经济补偿金的赔付金额按照员工在公司工作的年限来确定，每满一年支付一个月工资。如果公司无故辞退员工，可能还需要支付双倍的经济补偿金或赔偿金。

建议公司在做出辞退决定之前，仔细审查相关法律法规和合同条款，确保公司的决策符合法律规定和合同约定。同时，公司也可以与员工进行充分沟通，了解员工不配合调动的具体原因，并尽可能通过协商解决争议。