建立基本医疗保障基金综合监管制度，健全协同执法工作机制，涉及的部门有：

1. 医保行政部门：负责制定医保监管政策，组织实施监管工作。
2. 医保经办机构：负责日常监管和专项检查，受理群众举报投诉，组织调解处理相关争议。
3. 卫生健康、市场监管、审计等部门：按照各自职责，共同做好医保基金监管工作。
4. 社会监督组织：包括媒体、消费者权益保护组织等，负责对医保监管工作的监督和舆论引导。
5. 公安机关：负责打击医保基金领域的违法犯罪行为，维护医保秩序。

各部门需要加强沟通协作，形成监管合力，共同维护基本医疗保障基金的安全和正常运行。