**是的，《国家地表水环境质量监测网监测任务作业指导书(试行)》已经作废了**。

生态环境部办公厅发布了《关于做好废止和修订水环境质量监测方面规范性文件工作的通知》，其中表示《国家地表水环境质量监测网监测任务作业指导书(试行)》等规范性文件已经完成了其阶段性工作任务，需要废止。故所有的地表水环境质量监测站需要按照新的要求和规定进行工作，以保证地表水环境监测工作的顺利进行。