新三板挂牌初始登记费的会计科目可根据实际情况而定，一般可以记入“管理费用”、“无形资产”或“营业外支出”等科目。具体取决于该费用的性质和公司政策。

这些信息仅作参考，请以实际情况为准。如有需要，建议咨询专业人士获取有价值的建议。